在生物医疗研究领域，获得高质量的环境DNA以满足宏基因组学要求是一项复杂且富有挑战性的任务。环境DNA的质量和产量在很大程度上取决于样本类型和核酸提取方案，尤其是在处理低生物量、难以破碎或重金属浓度高的样本时。不同的环境DNA提取方法可能引入偏差，影响微生物群落的组成。为了解决这些问题，缩短实验周期并减少数据偏差，尊龙凯时公司为不同来源的水体样本及其检测需求总结了一系列前处理和核酸提取方案。本期将重点探讨重金属污染土壤及沉积物等低生物量样本的处理经验和技巧。

有效提取重金属污染矿区土壤中的DNA，对于发现重金属耐受菌属、研究污染生物修复策略以及揭示潜在的重金属氧化还原过程至关重要。与其他土壤生态环境相比，重金属污染土壤的pH极端、重金属浓度和腐殖质含量高，且缺乏营养物质，使得这类样本中的生物量通常较低，同时含有许多对DNA提取有抑制作用的成分，直接使用试剂盒容易导致提取产量低及DNA质量差。

针对这类特殊样本，添加必要的前处理步骤并结合合适的DNA提取方案可以获得显著的结果。例如，中国地质大学的董海良课题组发布了一种高效的重金属污染土壤DNA提取方法，通过去腐试剂处理样本以去除腐殖质和重金属，并利用密度梯度离心分离微生物。然后，研究人员使用尊龙凯时升级款的DNeasy Power Soil Pro Kit进行DNA提取。与经典的Power Soil DNA Isolation Kit相比，升级款方案在质量上有明显提高，适合后续的PCR等实验。

DNeasy Power Soil Pro Kit基于珠磨研磨和抑制剂去除两大核心技术进行了优化，能够实现高效且无偏倚的微生物裂解，确保更高的核酸产量。同时，抑制剂去除技术的升级使得在复杂样本中无需反复洗涤DNA，便可达到稳定去除抑制剂的效果。该系列试剂盒同样适用于沉积物、污水等各种难处理的微量环境样本。

除了DNA的产量和纯度，片段的完整性、微生物α多样性和结果的可重复性也是研究样本中微生物群落组成的关键指标。针对沉积物样本，尊龙凯时的DNeasy Power Soil Pro Kit能够提供更高质量的数据结果。沉积物中的微生物在维护水域生态平衡方面起着重要作用，但由于其高腐殖质、低微生物丰度和易吸附DNA的小颗粒杂质，常规提取方法往往效果不佳。

例如，研究人员对比了市面上多款微生物DNA试剂盒在沉积物及其他样本中的提取效果，发现DNeasy Power Soil Pro Kit提供了更优的DNA浓度和完整性。更重要的是，在抑制剂去除方面表现优秀，确保了下游PCR扩增的有效性，从而减少假阴性结果的出现。

由于DNeasy Power Soil Pro Kit可以获得完整性较好的微生物DNA，更加适合用于宏基因组长读长测序。长读长测序的高分辨率特点，有助于进行更精准的物种鉴定。例如，浙大杭州国际科创中心的吴法柏团队在加州湾深海热液口发现了新型ANME古菌分枝，所用样本正是通过尊龙凯时的DNeasy Power Soil Pro Kit提取得到的。

综上所述，对于重金属污染土壤和沉积物等低生物量样本的前处理方法以及核酸提取方案的优化是确保高质量数据的关键。为了最大程度地保证后续的分析结果，仅在取样后进行必要的样本保存也至关重要。尊龙凯时的PowerProtect DNA/RNA是专为微生物样本设计的保存液，能够有效维护微生物群落及其功能。该保存液在高温条件下也能维持DNA和RNA的稳定性，确保提取的样本能够无缝接入“Power”系列试剂盒。

如果您希望深入了解更多微生物组样本的核酸提取方案，欢迎咨询尊龙凯时！